Проблема в том, что за каждым пунктам меню стоят определенные действия. Вот например объединение конфигураций.

Но это пункт меню не о чем не говорит. Есть он такой и есть. А что стоит за этим, как это реально происходит вот главный вопрос. Давайте попробуем сравнить две одинаковые конфигурации. При выборе этого пункта меню Вам нужно будет указать файл конфигурации.

Дальше пойдет сравнение. Результат как не странно правильный.

Это когда одинаковые. Для проверки я создам два каталога conf1 и conf2 так как нужно этот вопрос изучить внимательнее.

И помещу туда две одинаковые конфигурации как описано в шаге - Шаг 365 - Как скопировать конфигурацию. conf1 будет рабочей а conf2 для изменений. Вопрос не праздный иначе Вы либо будете работать по ночам либо предприятие будет стоять.